1948년 4월 3일 제주도에서 일어난 4 ㆍ3사건은 또 하나의 비극이었다.

1948년 4월 3일 새벽 2시 남로당 제주도당 군사부사령관 김달삼의 지휘아래 1천5백여명의 공산폭도들이 일제히 무장봉기, 도내 20개 경찰지서 중 10개소를 급습해 무기를 탈취하는 한편 관공서, 경찰관사, 서북청년단 숙소 등을 습격하는 이른바 '제주 4ㆍ3사건'이 발생했다.

이들은 숙청자 명단에 오른 우익인사들을 인민재판에 회부, 처형하면서 제주도 전역을 혼란에 빠뜨렸다. 이들은 한라산을 근거지로 유격전을 펼치며 1년동안이나 저항했다. 이 여파로 제주도에서는 5ㆍ10 총선거를 치르지 못했다.

진압에 나선 미군정과 이승만 정권은 1949년 5월까지 대규모 군사토벌작전을 5차례나 벌여 이들을 토벌하는데 성공했지만 이 과정에서 무고한 양민들의 피해가 속출했다. 제주 4ㆍ3사건 관련 보고서들에 따르면 도민 28만명 중 5만여명이 죽었고 모든 마을의 77%가 초토화되어 이재민이 10만여명이나 발생한 것으로 밝혀졌다. 이 사건은 간접적으로 여순 14연대 반란에까지 이어져 또다시 수많은 양민이 희생됐다.

2003년 10월 31일 노무현 제16대 대통령이 '제주 4ㆍ3 사건'에 대해 추모사업과 명예회복 등에 대한 지원을 약속함으로써 4ㆍ3사건 발생 55년 만에 정부차원의 첫 공식사과가 이루어졌다.