476개 시민단체가 참여하고 있는 '2000년 총선시민연대'는 2000년 1월 24일 기자회견을 갖고 16대 총선 공천반대 인사 66명을 발표했다. 명단에는 자민련의 김종필 명예총재, 박준규 국회의장, 한나라당의 황낙주 김수한 전 국회의장과 국민회의 권노감 전 의원 김상현 서석재 김윤환 의원 등 여야 중진 의원들이 대거 포함됐다.

정당별로는 새천년민주당 16명, 자민련 16명, 한나라당 29명, 무소속 5명으로 나타났다. 숫자상으로는 한나라당이 가장 많았으나, 의원 비율로는 30.2%를 차지한 자민련이 가장 높았다. 총선시민연대의 낙선 리스트 작성은 15대 국회 전-현직 의원 329명을 대상으로 이루어져, 14대 이전 국회의원들과 원외 정치인들은 제외됐다. 박원순 상임집행위원장은 "뇌물수수와 선거법 위반, 쿠데타 등 헌정질서 파괴 등의 기준을 가장 우선적으로 적용해 명단을 작성했다"고 말했다. 총선시민연대는 2월 2일 2차 공천반대 대상자 47명을 추가 발표했다.

한편 대법원은 총선 이듬해 2월 16대 총선에서 총선시민연대가 벌인 낙선운동은 선거법 위반이라고 판결했다. 대법원의 판결은 시민단체가 정치개혁이라는 명분을 내세워 실정법을 어긴 데 대해 법원이 엄정한 법집행 의지를 강조한 것으로 풀이됐다.